Pokud podnikatel uplatňoval výdaje paušálem, musel stále vést nějaký soupis příjmů a mnozí, kteří se teď zaregistrovali pro daňový paušál, si myslí, že to dělat už nemusí, ale FÚ jim to za rok při kontrole zcela jistě vysvětlí... a když ta kontrola příjde až za 3 roky, bude to ještě horší.
Podnikatel s výdajovým paušálem musí platit 2 zálohy měsíčně a na konci roku to dopočte a přizná. To při paušální dani odpadne, ale má to dost dalších nevýhod. Např. nelze příjem rozdělit na manželku a nelze uplatnit ani další bonusy a odečty.
Daňový paušál je v podstatě daň za lenost s tím, že se to může kdykoli obrátit proti plátci samotnému.