Denní souhrn testů na COVID-19 a hodnocení indexu rizika pro Protiepidemický systém (PES) k 8. 3. 2021

Dne 07.03.2021 bylo provedeno 10 623 testů PCR a 30 568 antigenních testů, a to u 40 975 unikátních testovaných osob. Testy s preventivní indikací a prováděné v rámci plošného testování tvořily 74,6 % celkového počtu testů.

Celkem bylo potvrzeno 3 923 pozitivních diagnóz COVID-19, přičemž AG testy se na tomto záchytu podílely z 25,2 % (týdenní průměr podílu AG testů na pozitivních záchytech se pohybuje v rozsahu cca 20 %). COVID-19 byl prokázán u 1 610 asymptomatických osob, z toho v 291 případech na bázi AG testu následně potvrzeného vyšetřením PCR.

Testy se dle uvedené indikace vyšetření významně liší v dosahované pozitivitě záchytu nemoci COVID-19 (7denní průměrná pozitivita):

diagnostické a klinické indikace testů vykazují pozitivitu 38,9 %,
testy s epidemiologickou indikací (rizikové kontakty, trasování) mají 20,5% pozitivitu,
testy s preventivní indikací a při plošném testování dosahují 1,6% pozitivity

Od 6. 1. 2021 jsou denně aktualizovány hodnoty indexu rizika, který je kalkulován pro Protiepidemický systém (PES).

Hodnota indexu kalkulovaného na bázi nové metodiky je k 8. 3. 2021 76 bodů ze 100. Detaily jsou k dispozici na https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/pes. K vysoké hodnotě indexu přispívají všechny komponenty indexu, které nabývají vysokých hodnot, konkrétně:

· 14denní incidence na 100 tis. obyv.:	1 570,1
· 14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+:	1 116,5
· Zjednodušené reprodukční číslo:	1,01
· Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě za posledních 14 dní:	42,2%

Číselné souhrny jsou uvedeny v následujících tabulkách a v datových přílohách této zprávy.

Přehled provedených testů

Denní souhrn za 07.03.2021	/generováno 08.03.2021/

Počet provedených (nahlášených) testů	Za 7.3.	Počet otestovaných osob*	Za 6.3.	Počet otestovaných osob*
PCR testů	10 623	40 975	21 975	51 415
Antigenní (Ag) testy	30 568	29 856
…z toho prvotesty	12 961	16 161

Počet pozitivních diagnóz COVID-19	Za 7.3.	… v %	Za 6.3.	… v %
Celkem	3 923	100%	9 092	100%
PCR – symptomatičtí pacienti	1 617	41,2%	4 618	50,8%
PCR – asymptomatičtí pacienti	1 319	33,6%	3 107	34,2%
Ag – symptomatičtí pacienti	696	17,7%	681	7,5%
Ag – asymptomatičtí pacienti /konfirmace PCR/**	291	7,4%	686	7,5%

Počet testů dle indikace	Za 7.3.	… v %	Za 6.3.	… v %
Celkem	41 191	100%	51 831	100%
Diagnostická indikace	6 074	14,7%	12 531	24,2%
Epidemiologická indikace	3 221	7,8%	6 256	12,1%
Preventivní a plošné testování	30 730	74,6%	31 012	59,8%
Ostatní	1 166	2,8%	2 032	3,9%

Relativní pozitivita testů dle indikace testu***	Za 7.3.	Za 6.3.	7denní průměr k 6.3.
Diagnostická indikace	39,2%	46,2%	39,0%
Epidemiologická indikace	18,9%	25,9%	20,9%
Preventivní a plošné testování	1,1%	2,4%	1,7%

Počet evidovaných testů	Za 7 dní k 7.3.	Za 7 dní k 6.3.	Celkem v databázi
PCR testy	235 929	237 012	5 608 394
Antigenní testy	420 300	417 710	3 143 777

* Jeden klient může mít proveden Ag i PCR test, počet otestovaných osob není roven součtu testů

** Tyto testy nejsou zahrnuty v záchytech nemoci u testů PCR

*** Relativní pozitivita testů může být v posledním dni ovlivněna nedohlášením negativních testů v daném okamžiku (v případě velkého počtu testů jsou pro zpracování prioritizovány pozitivní testy a negativní testy jsou z laboratoří hlášeny postupně). Z toho důvodu dochází zpětně (cca 1 – 3 dny) ke korekcím průběžně hlášených hodnot.

Index rizika pro Protiepidemický systém PES: 8. 3. 2021*

INDEX RIZIKA k datu 08.03.2021: 76 bodů
Hodnota 07.03.2021: 76 bodů	Index rizika dlouhodobě kolísá mezi 75 a 80 body a odráží tak rizikovost vývoje epidemie. Hodnoty jsou zpětně korigovány, neboť nemocnice se zpožděním 1–2 dnů doplňují a po kontrolách korigují hlášení nových příjmů pacientů, kteří byli pozitivně testováni až v nemocnici (viz též poznámka níže).
Hodnota 06.03.2021: 76 bodů
Hodnota 05.03.2021: 76 bodů
Hodnota 04.03.2021: 76 bodů
Hodnota 03.03.2021: 76 bodů
Hodnota 02.03.2021: 79 bodů

Poznámka: U komponenty Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě (za posledních 14 dní) dochází ke zpětnému dohlašování hospitalizací a z toho důvodu se tato komponenta může změnit i pro již uplynulé dny. V případě, že se hodnoty pohybují v blízkosti bodové hranice, může tedy dojít i ke změně počtu bodů připočítaných za tuto komponentu a tím pádem i ke změně hodnoty celého indexu.

Komponenty indexu rizika	Hodnota	Počet bodů
14denní incidence na 100 tis. obyv.	1 570,1	20
14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+	1 116,5	20
Zjednodušené reprodukční číslo	1,01	9
Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě (za posledních 14 dní)	42,2%	25
Nárůst 14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+	ano	2
Nárůst podílu hospitalizovaných nezachycených v komunitě	ne	0
CELKEM		76

* Index rizika je od 6.1. 2021 kalkulován dle metodiky výpočtu publikované zde: https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/pes

Doplňující metodický komentář k publikovaným datům o testování COVID-19

Datové sady s diagnostickými testy na COVID-19 jsou od 16. 11. 2020 doplněny dle mezinárodních metodik ECDC. Nově jsou do evropské definice potvrzeného případu zahrnuty také antigenní testy (AG). Detekce nukleové kyseliny nebo antigenu viru SARS-CoV-2 v klinickém vzorku je nyní laboratorním kritériem. ECDC v současnosti publikuje výpočet relativní pozitivity testů pro veškeré testy provedené v daném týdnu (jmenovatel). Čitatelem pro výpočet pozitivity testů je počet nově potvrzených případů v daném týdnu

https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/surveillance/case-definition
http://www.szu.cz/tema/prevence/definice-pripadu-case-definitiono-koronavirove-onemocneni
https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/covid-19-testing

Doplnění datových sad zajišťuje shodu údajů s mezinárodně publikovanými daty, které ČR hlásí podle metodik ECDC do zahraničních databází. Jako testy určující denní počet nově diagnostikovaných případů jsou nadále uvažovány pouze testy primárně pozitivní. V ČR situaci významně změnilo zavedení opakovaného plošného testování AG testy jako modality plně hrazené z veřejného zdravotního pojištění. Počty vykazovaných AG testů již nyní dosahují úrovně řádově srovnatelné s testy PCR. Prováděné AG testy se z velké části týkají preventivních vyšetření a mění spektrum testovaných u PCR testů: vysoký podíl klinických indikací zvyšuje jejich pozitivitu. Narůstá diverzita indikací k testování COVID-19 a zvyšuje se dostupnost a denní počet prováděných testů. Hodnocení relativní pozitivity záchytu nemoci spojováním dat různých testů a různých indikací není nadále smysluplné. Hodnocení relativní pozitivity záchytu nemoci tak musí rozlišovat především důvody pro vyšetření, cílové skupiny, různé indikace testů a klinickou závažnost stavu pacientů.

Doplňující metodický komentář k antigenním testům

Testy pro průkaz antigenu musí pro použití v ČR splňovat požadavky na kvalitu, senzitivitu >90% a specificitu >97% (cca u 3 % může jít o falešně pozitivní nález). Používané testy musí mít evropskou certifikaci CE IVD. V ČR jsou využívány antigenní testy více výrobců. Všechny dosud používané testy včetně odběru biologického materiálu musí provádět zdravotnický pracovník. Správnost a kvalita odběru materiálu na vyšetření je zásadní pro úspěšnost testu. Výsledek vyšetření antigenním testem vypovídá pouze o situaci ve chvíli odběru vyšetřovaného materiálu.

V situaci s vysokou prevalencí (přítomností) infekce v populaci lze pomocí testů na průkaz antigenu detekovat infekčního jedince v komunitě a včas snížit tlak na zdravotní péči. V takové chvíli je riziko neodhalení všech případů (riziko falešně negativních výsledků) vyváženo včasností výsledků a možností sériového testování jednotlivců. Při interpretaci výsledku antigenního testu je nutné pracovat s informací, že:

práh detekce testu neumožňuje identifikovat přítomnost SARS-CoV-2 u cca 30–50 % jedinců bez příznaků onemocnění COVID-19, ale přitom tito vykazují pozitivitu metodou PCR
u osob s příznaky onemocnění není diagnóza COVID-19 antigenním testem stanovena cca u 25 % případů (možnost i jiného respiračního onemocnění)
negativní výsledek antigenního testu tak nevylučuje možnost, že jedinec je infekční anebo že se stane infekčním v blízkém časovém odstupu od vyšetření

Využití antigenních testů pro hromadné testování je užitečné pro odhalení lidí s vysokou produkcí viru, kterým je dále poskytnuta cílená zdravotní péče, a především poučení o opatřeních, která musí dodržovat, aby zabránili ohrožení dalších osob ve svém okolí. Důležitý je pozitivní výsledek. Negativní výsledek však infekci nevylučuje.