Denní souhrn testů na COVID-19 a hodnocení indexu rizika pro Protiepidemický systém (PES) k 5. 2. 2021

Ministerstvo zdravotnictví denně aktualizuje souhrn provedených testů na COVID-19. Detaily včetně zveřejněné datové sady jsou k dispozici na adrese https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/covid-19.

Dne 04. 2. 2021 bylo provedeno 26 316 testů PCR a 28 191 antigenních testů, a to u 53 979 unikátních testovaných osob. Testy s preventivní indikací a prováděné v rámci plošného testování tvořily 47,2 % celkového počtu testů.

Celkem bylo potvrzeno 8 032 pozitivních diagnóz COVID-19, přičemž AG testy se na tomto záchytu podílely z 16,9 % (týdenní průměr podílu AG testů na pozitivních záchytech se pohybuje v rozsahu cca 20%). COVID-19 byl prokázán u 3 020 asymptomatických osob, z toho v 457 případech na bázi AG testu následně potvrzeného vyšetřením PCR.

Testy se dle uvedené indikace vyšetření významně liší v dosahované pozitivitě záchytu nemoci COVID-19 (7denní průměrná pozitivita):

diagnostické a klinické indikace testů vykazují pozitivitu 26,8 %,
testy s epidemiologickou indikací (rizikové kontakty, trasování) mají 19,4% pozitivitu,
testy s preventivní indikací a při plošném testování dosahují 2,3% pozitivity

Od 6. 1. 2021 jsou denně aktualizovány hodnoty indexu rizika, který je kalkulován pro Protiepidemický systém (PES) podle nové metodiky. Parametr „Relativní pozitivita záchytu nemoci“ je v indexu nahrazen podílem hospitalizovaných pacientů s COVID-19, kteří nebyli zachyceni testováním a trasováním („Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě, za posledních 14 dní“).

Hodnota indexu kalkulovaného na bázi nové metodiky je k 05.02.2021 71 bodů ze 100. Detaily jsou k dispozici na https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/pes. K vysoké hodnotě indexu přispívají všechny komponenty indexu, které nabývají vysokých hodnot, konkrétně:

· 14denní incidence na 100 tis. obyv.:	901,8
· 14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+:	745,4
· Zjednodušené reprodukční číslo:	1,03
· Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě za posledních 14 dní:	47,5%

Číselné souhrny jsou uvedeny v následujících tabulkách a v datových přílohách této zprávy.

Přehled provedených testů

Denní souhrn za 4. 2. 2021		(generováno 5. 2. 2021)

Počet provedených (nahlášených) testů	Za 4. 2.	Počet otestovaných osob *
PCR testů	26 316
Antigenní (Ag) testy	28 191	53 979
…z toho prvotesty	16 165

Počet pozitivních diagnóz COVID-19	Za 4. 2.	… v %
Celkem	8 032	100%
PCR – symptomatičtí pacienti	4 108	51,1%
PCR – asymptomatičtí pacienti	2 563	31,9%
Ag – symptomatičtí pacienti	904	11,3%
Ag – asymptomatičtí pacienti /konfirmace PCR/**	457	5,7%

Počet testů dle indikace	Za 4. 2.	… v %
Celkem	54 507	100%
Diagnostická indikace	20 061	36,8%
Epidemiologická indikace	7 362	13,5%
Preventivní a plošné testování	25 726	47,2%
Ostatní	1 358	2,5%

Relativní pozitivita testů dle indikace testu	Za 4. 2.	7denní průměr
Diagnostická indikace	28,2%	26,8%
Epidemiologická indikace	19,2%	19,4%
Preventivní a plošné testování	2,2%	2,3%

Počet evidovaných testů	Za 7 dní	Celkem v databázi
PCR testy	167 121	4 713 843
Antigenní testy	194 844	1 731 915

* Jeden klient může mít proveden Ag i PCR test, počet otestovaných osob není roven součtu testů

** Tyto testy nejsou zahrnuty v záchytech nemoci u testů PCR

Index rizika pro Protiepidemický systém PES: 5. 2. 2021 *

INDEX RIZIKA k datu 5. 2. 2021: 71 bodů
Hodnota 04.02.2021: 71 bodů	Index se k 5. 2. 2021 v porovnání s předchozím dnem nezměnil.
Hodnota 03.02.2021: 70 bodů
Hodnota 02.02.2021: 73 bodů
Hodnota 01.02.2021: 73 bodů
Hodnota 31.01.2021: 70 bodů
Hodnota 30.01.2021: 70 bodů

Komponenty indexu rizika	Hodnota	Počet bodů
14denní incidence na 100 tis. obyv.	901,8	16
14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+	745,4	16
Zjednodušené reprodukční číslo	1,03	9
Podíl hospitalizovaných nezachycených v komunitě (za posledních 14 dní)	47,5%	30
Nárůst 14denní incidence 65+ na 100 tis. obyv. 65+	ne	0
Nárůst podílu hospitalizovaných nezachycených v komunitě	ne	0
CELKEM		71

* Index rizika je od 6. 1. 2021 kalkulován dle nové metodiky výpočtu
(https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/pes)

Doplňující metodický komentář k publikovaným datům o testování COVID-19

Datové sady s diagnostickými testy na COVID-19 jsou od 16. 11. 2020 doplněny dle mezinárodních metodik ECDC. Nově jsou do evropské definice potvrzeného případu zahrnuty také antigenní testy (AG). Detekce nukleové kyseliny nebo antigenu viru SARS-CoV-2 v klinickém vzorku je nyní laboratorním kritériem. ECDC v současnosti publikuje výpočet relativní pozitivity testů pro veškeré testy provedené v daném týdnu (jmenovatel). Čitatelem pro výpočet pozitivity testů je počet nově potvrzených případů v daném týdnu

Doplnění datových sad zajišťuje shodu údajů s mezinárodně publikovanými daty, které ČR hlásí podle metodik ECDC do zahraničních databází. Jako testy určující denní počet nově diagnostikovaných případů jsou nadále uvažovány pouze testy primárně pozitivní. V ČR situaci významně změnilo zavedení opakovaného plošného testování AG testy jako modality plně hrazené z veřejného zdravotního pojištění. Počty vykazovaných AG testů již nyní dosahují úrovně řádově srovnatelné s testy PCR. Prováděné AG testy se z velké části týkají preventivních vyšetření a mění spektrum testovaných u PCR testů: vysoký podíl klinických indikací zvyšuje jejich pozitivitu. Narůstá diverzita indikací k testování COVID-19 a zvyšuje se dostupnost a denní počet prováděných testů. Hodnocení relativní pozitivity záchytu nemoci spojováním dat různých testů a různých indikací není nadále smysluplné. Hodnocení relativní pozitivity záchytu nemoci tak musí rozlišovat především důvody pro vyšetření, cílové skupiny, různé indikace testů a klinickou závažnost stavu pacientů.

Doplňující metodický komentář k antigenním testům

Testy pro průkaz antigenu musí pro použití v ČR splňovat požadavky na kvalitu, senzitivitu >90% a specificitu >97% (cca u 3 % může jít o falešně pozitivní nález). Používané testy musí mít evropskou certifikaci CE IVD. V ČR jsou využívány antigenní testy více výrobců. Všechny dosud používané testy včetně odběru biologického materiálu musí provádět zdravotnický pracovník. Správnost a kvalita odběru materiálu na vyšetření je zásadní pro úspěšnost testu. Výsledek vyšetření antigenním testem vypovídá pouze o situaci ve chvíli odběru vyšetřovaného materiálu.

V situaci s vysokou prevalencí (přítomností) infekce v populaci lze pomocí testů na průkaz antigenu detekovat infekčního jedince v komunitě a včas snížit tlak na zdravotní péči. V takové chvíli je riziko neodhalení všech případů (riziko falešně negativních výsledků) vyváženo včasností výsledků a možností sériového testování jednotlivců. Při interpretaci výsledku antigenního testu je nutné pracovat s informací, že:

práh detekce testu neumožňuje identifikovat přítomnost SARS-CoV-2 u cca 30–50 % jedinců bez příznaků onemocnění COVID-19, ale přitom tito vykazují pozitivitu metodou PCR
u osob s příznaky onemocnění není diagnóza COVID-19 antigenním testem stanovena cca u 25 % případů (možnost i jiného respiračního onemocnění)
negativní výsledek antigenního testu tak nevylučuje možnost, že jedinec je infekční anebo že se stane infekčním v blízkém časovém odstupu od vyšetření

Využití antigenních testů pro hromadné testování je užitečné pro odhalení lidí s vysokou produkcí viru, kterým je dále poskytnuta cílená zdravotní péče, a především poučení o opatřeních, která musí dodržovat, aby zabránili ohrožení dalších osob ve svém okolí. Důležitý je pozitivní výsledek. Negativní výsledek však infekci nevylučuje.